在知网进行自然基金本子的查重，首先需要注册一个账号并登录。接着上传您的本子文档，系统会自动进行查重分析，给出重复率等相关数据。在查重结果中，会标注出重复的内容，并可提供修改建议。您可以根据系统提示进行修改，最终完成自然基金本子的查重流程。

此外，在进行自然基金本子查重时，建议您提前准备好原始文档和参考文献清单，以便系统更准确地进行比对。同时，注意文献引用格式的规范性，避免误判。在修改过程中，可以结合系统给出的建议，逐条检查修改，确保文本原创性和学术规范性。